GoboLinux es una distribución GNU/Linux realmente alternativa, alternativa en cuanto a su sistema de gestión de paquetes, principalmente, ¡por que no necesita gestor de paquetes!. El propio sistema de ficheros es el gestor de paquetes. Con GoboLinux mantienes siempre ordenados tus paquetes, conociendo en todo momento que paquetes tienes instalados y que ficheros instala cada paquete, y todo ello usando los mismos programas que usas habitualmente en la consola para administrar los ficheros.

Comandos útiles:

1. InstallPackage : Este comando te permite instalar paquetes binarios en tu sistema, los paquetes se descargan desde el repositorio de GoboLinux y se instalan bajo /Programs.
   ejemplo:InstallPackage AsciiDoc
   
2. Compile : Con este comando puedes compilar \"recetas\", las recetas son unos pequeños ficheros que le dicen a Compile como compilar el programa e instalarlo, al final si todo va bien tienes tu programa bajo /Programs.
   ejemplo:Compile AsciiDoc
   
3. DisableProgram: Esta herramienta te permite desabilitar un programa, es decir no lo desinstala pero elimina los enlaces necesarios para que el programa pueda funcionar.
   ejemplo:DisableProgram AsciiDoc
   
4. SymlinkProgram: Esta herramienta te permite hacer justo lo contrario, habilitar el programa, crea los enlaces necesarios para que el programa pueda funcionar.
   ejemplo:SymlinkProgram AsciiDoc

Ficheros de Configuración:
Todos los ficheros de configuración se encuentran en /System/Settings, algunos de los ficheros principales son:

1. /System/Settings/NetworkOptions: Con este fichero puedes configurar la red.
   
2. /System/Settings/BootOptions: Este fichero configura algunos de los parámetros de arranque de GoboLinux, como por ejemplo el teclado, el ratón, la fuente de la consola, etc...